El programa de Asistencia Técnica de la FCD depende de construir y mantener alianzas exitosas con organizaciones socias. Para que ocurran resultados duraderos, debe existir una sólida colaboración.
Este grupo de actores incluye a:
- El Servicio del Parque Nacional de Galápagos
- El Instituto Nacional Galapagos (INGALA)
- SESA-Galápagos (el servicio de cuarentena)
- Empresas y organizaciones locales
Para lograr sus objetivos, FCD también trabaja con el gobierno de Ecuador, las municipalidades de Galápagos, e instituciones locales, provinciales y nacionales.
FCD también tiene valiosas alianzas con la comunidad científica de todo el mundo.

