Se deben implementar medidas firmes de bioseguridad en coordinación con todos las partes interesadas en Galápagos. FCD proporciona asistencia técnica a agricultores, SESA (Servicio Ecuatoriano de Sanidad Agropecuaria) y SICGAL (Sistema de Inspección y Cuarentena para Galápagos), el Parque Nacional de Galápagos, el Ministerio de Agricultura y otras organizaciones gubernamentales.
Las especies invasoras siguen representando la mayor amenaza para la biodiversidad de Galápagos. La migración, el turismo y el comercio en aumento ofrecen oportunidades en constante aumento para que dichas especies lleguen a Galápagos.
FCD realiza estudios de línea de base, actividades de monitoreo, indica prioridades, desarrolla y prueba técnicas de manejo, y brinda apoyo al desarrollo de las capacidades locales para manejar las especies invasoras.
FCD ha sido un actor clave en el Fondo para el Medio Ambiente Mundial (GEF) y los programas para especies invasoras de la Fundación de las Naciones Unidas (FNU) en Galápagos y ayuda a las autoridades locales a aplicar las lecciones aprendidas de los mismos. El Proyecto Isabela ilustra el éxito de dichos esfuerzos.