La presencia de especies introducidas en Galápagos produce alteración y daño al medio ambiente, además de a los seres humanos. Los esfuerzos de control han estado dirigidos a las zonas protegidas del Parque Nacional de Galápagos, pero no ha habido muchas acciones que pongan énfasis en el manejo de dichos problemas en los sitios no habitados. Para abordar esa necesidad, en cada isla, se creó un Comité Interinstitucional de Manejo de Especies Introducidas (CIMEI) – una organización con miembros voluntarios que tienen representantes de varias instituciones locales diferentes.
Dichos foros buscan ayudar a reducir los posibles conflictos y respaldar la participación efectiva de los grupos que tienen que ver con el control de especies introducidas. Están ubicados en las Islas San Cristóbal, Isabela y Santa Cruz ; el de San Cristóbal fue el primero en implementar acciones en 2001.
Su creación fue desarrollada en virtud de un marco de colaboración institucional y definida por la ordenanza de la municipalidad local, que reglamenta las condiciones y restricciones que se deben aplicar respecto de la tenencia de animales domésticos dentro del perímetro urbano.
Entre los miembros institucionales de la CIMEI de cada isla se cuentan: Gobierno Municipal, Parque Nacional Galápagos, Servicio Ecuatoriano de Sanidad Agropecuaria, Unidad de Protección Ambiental de la Policía Nacional, Instituto Nacional Galápagos, Ministerio de Salud, Fundación WildAid, Araucaria y Fundación Charles Darwin entre otras.
Los logros de la CIMEI han sido: la campaña de erradicación de la paloma doméstica Columbia livia en Puerto Ayora y San Cristóbal; el programa de esterilización de mascotas (gatos y perros) en San Cristóbal, Santa Cruz e Isabela; el manejo y gestión de programas de mascotas y campañas educativas dirigidas a la población local y que incluyen a los centros de educación primaria de San Cristóbal e Isabela. Las campañas para erradicación de ratas de las zonas pobladas de las islas habitadas todavía está en la etapa de planificación.
Como parte de su campaña de manejo de mascotas en San Cristóbal, el personal y los colaboradores del CIMEI, por la noche, capturan a los perros extraviados en las calles de la ciudad. Los animales capturados son devueltos a sus casas cuando es posible, u ofrecidos en adopción. CIMEI además ofrece un programa de esterilización muy exitoso para gatos y perros, lo cual fue bien recibido por la comunidad local.