La Ley Especial para Galápagos de 1998 dictamina una reforma educativa integral, con la meta de incorporar "la preservación y conservación ambiental y las características socioeconómicas de la provincia (de las islas Galápagos)".
FCD ha asumido un papel protagónico en el aspecto de elaborar métodos de aprendizaje participativos y nuevos programas de educación que apuntan a dar a los residentes de Galápagos, sobre todo a los jóvenes, los conocimientos y las destrezas que necesitarán para desempeñar un papel de liderazgo positivo en el manejo Galápagos.
Trabajando en asociación con las autoridades de educación de las Islas Galápagos, la FCD está elaborando un plan de estudios de educación ambiental basado en programas que han estado en funcionamiento varios años en los Centros de Educación Ambiental de la FCD. Durante 2006, FCD espera desarrollar dicho plan de estudios para realizar un programa piloto en las escuelas de la Isla Santa Cruz, antes de lanzarlo para todas las escuelas de Galápagos.